横滨市立大学附属机构包括有木原生物学研究所、大学医院、图书馆、学术信息中心、医学信息中心。学校在研究方面采用了21世纪COE教学大纲，医学系以细胞急性系统研究为基础所进行的未来医疗创成研究，入选了日本教育部资金扶持计划。横滨市立大学是日本一所小规模..大学，在2024年QS..大学排名当中，横滨市立大学位列..第801-850名的区间 。